Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN1

Kars, Lysine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KarsQ99MN1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KarsQ99MN1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KarsQ99MN1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KarsQ99MN1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KarsQ99MN1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KarsQ99MN1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KarsQ99MN1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KarsQ99MN1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KarsQ99MN1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KarsQ99MN1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KarsQ99MN1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KarsQ99MN1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KarsQ99MN1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KarsQ99MN1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KarsQ99MN1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KarsQ99MN1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KarsQ99MN1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KarsQ99MN1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KarsQ99MN1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KarsQ99MN1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KarsQ99MN1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KarsQ99MN1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KarsQ99MN1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
KarsQ99MN1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
KarsQ99MN1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KarsQ99MN1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KarsQ99MN1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KarsQ99MN1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KarsQ99MN1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KarsQ99MN1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KarsQ99MN1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KarsQ99MN1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KarsQ99MN1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KarsQ99MN1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
KarsQ99MN1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KarsQ99MN1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KarsQ99MN1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KarsQ99MN1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KarsQ99MN1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KarsQ99MN1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KarsQ99MN1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KarsQ99MN1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KarsQ99MN1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KarsQ99MN1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KarsQ99MN1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KarsQ99MN1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KarsQ99MN1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KarsQ99MN1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KarsQ99MN1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KarsQ99MN1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KarsQ99MN1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KarsQ99MN1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KarsQ99MN1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KarsQ99MN1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KarsQ99MN1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KarsQ99MN1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KarsQ99MN1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KarsQ99MN1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KarsQ99MN1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KarsQ99MN1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
KarsQ99MN1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KarsQ99MN1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KarsQ99MN1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KarsQ99MN1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KarsQ99MN1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
KarsQ99MN1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KarsQ99MN1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KarsQ99MN1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KarsQ99MN1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KarsQ99MN1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KarsQ99MN1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KarsQ99MN1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KarsQ99MN1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KarsQ99MN1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KarsQ99MN1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KarsQ99MN1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KarsQ99MN1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KarsQ99MN1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KarsQ99MN1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KarsQ99MN1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KarsQ99MN1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KarsQ99MN1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KarsQ99MN1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KarsQ99MN1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KarsQ99MN1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KarsQ99MN1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KarsQ99MN1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KarsQ99MN1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KarsQ99MN1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KarsQ99MN1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KarsQ99MN1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KarsQ99MN1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KarsQ99MN1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KarsQ99MN1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KarsQ99MN1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KarsQ99MN1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KarsQ99MN1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KarsQ99MN1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KarsQ99MN1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KarsQ99MN1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms