Protein–RNA interactions for Protein: Q99MI1

Erc1, ELKS/Rab6-interacting/CAST family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erc1Q99MI1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Erc1Q99MI1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Erc1Q99MI1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Erc1Q99MI1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Erc1Q99MI1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Erc1Q99MI1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Erc1Q99MI1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Erc1Q99MI1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Erc1Q99MI1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Erc1Q99MI1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Erc1Q99MI1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erc1Q99MI1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erc1Q99MI1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erc1Q99MI1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erc1Q99MI1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erc1Q99MI1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Erc1Q99MI1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Erc1Q99MI1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Erc1Q99MI1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Erc1Q99MI1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Erc1Q99MI1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Erc1Q99MI1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Erc1Q99MI1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Erc1Q99MI1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Erc1Q99MI1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Erc1Q99MI1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Erc1Q99MI1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Erc1Q99MI1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Erc1Q99MI1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Erc1Q99MI1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Erc1Q99MI1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Erc1Q99MI1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Erc1Q99MI1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Erc1Q99MI1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Erc1Q99MI1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Erc1Q99MI1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Erc1Q99MI1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Erc1Q99MI1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Erc1Q99MI1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Erc1Q99MI1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Erc1Q99MI1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Erc1Q99MI1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Erc1Q99MI1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Erc1Q99MI1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Erc1Q99MI1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Erc1Q99MI1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Erc1Q99MI1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Erc1Q99MI1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Erc1Q99MI1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Erc1Q99MI1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Erc1Q99MI1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Erc1Q99MI1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Erc1Q99MI1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Erc1Q99MI1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Erc1Q99MI1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Erc1Q99MI1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Erc1Q99MI1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Erc1Q99MI1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Erc1Q99MI1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Erc1Q99MI1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Erc1Q99MI1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Erc1Q99MI1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Erc1Q99MI1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Erc1Q99MI1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Erc1Q99MI1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Erc1Q99MI1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Erc1Q99MI1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Erc1Q99MI1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Erc1Q99MI1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Erc1Q99MI1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Erc1Q99MI1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Erc1Q99MI1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Erc1Q99MI1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Erc1Q99MI1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Erc1Q99MI1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Erc1Q99MI1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Erc1Q99MI1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Erc1Q99MI1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Erc1Q99MI1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Erc1Q99MI1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Erc1Q99MI1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Erc1Q99MI1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Erc1Q99MI1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Erc1Q99MI1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Erc1Q99MI1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Erc1Q99MI1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Erc1Q99MI1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Erc1Q99MI1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Erc1Q99MI1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Erc1Q99MI1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Erc1Q99MI1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Erc1Q99MI1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Erc1Q99MI1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Erc1Q99MI1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Erc1Q99MI1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Erc1Q99MI1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Erc1Q99MI1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Erc1Q99MI1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Erc1Q99MI1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Erc1Q99MI1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms