Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Atp1b4Q99ME6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Atp1b4Q99ME6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Atp1b4Q99ME6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Atp1b4Q99ME6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Atp1b4Q99ME6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Atp1b4Q99ME6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Atp1b4Q99ME6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Atp1b4Q99ME6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Atp1b4Q99ME6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Atp1b4Q99ME6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Atp1b4Q99ME6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Atp1b4Q99ME6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Atp1b4Q99ME6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Atp1b4Q99ME6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Atp1b4Q99ME6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Atp1b4Q99ME6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Atp1b4Q99ME6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Atp1b4Q99ME6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Atp1b4Q99ME6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Atp1b4Q99ME6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Atp1b4Q99ME6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Atp1b4Q99ME6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Atp1b4Q99ME6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Atp1b4Q99ME6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Atp1b4Q99ME6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Atp1b4Q99ME6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Atp1b4Q99ME6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Atp1b4Q99ME6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Atp1b4Q99ME6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Atp1b4Q99ME6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atp1b4Q99ME6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atp1b4Q99ME6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atp1b4Q99ME6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Atp1b4Q99ME6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Atp1b4Q99ME6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Atp1b4Q99ME6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Atp1b4Q99ME6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Atp1b4Q99ME6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Atp1b4Q99ME6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Atp1b4Q99ME6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Atp1b4Q99ME6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Atp1b4Q99ME6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Atp1b4Q99ME6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Atp1b4Q99ME6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Atp1b4Q99ME6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Atp1b4Q99ME6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Atp1b4Q99ME6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Atp1b4Q99ME6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Atp1b4Q99ME6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Atp1b4Q99ME6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Atp1b4Q99ME6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Atp1b4Q99ME6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Atp1b4Q99ME6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Atp1b4Q99ME6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Atp1b4Q99ME6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Atp1b4Q99ME6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Atp1b4Q99ME6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Atp1b4Q99ME6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Atp1b4Q99ME6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Atp1b4Q99ME6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Atp1b4Q99ME6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Atp1b4Q99ME6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Atp1b4Q99ME6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Atp1b4Q99ME6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Atp1b4Q99ME6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Atp1b4Q99ME6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Atp1b4Q99ME6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Atp1b4Q99ME6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Atp1b4Q99ME6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Atp1b4Q99ME6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Atp1b4Q99ME6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Atp1b4Q99ME6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Atp1b4Q99ME6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Atp1b4Q99ME6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Atp1b4Q99ME6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Atp1b4Q99ME6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Atp1b4Q99ME6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Atp1b4Q99ME6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Atp1b4Q99ME6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Atp1b4Q99ME6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Atp1b4Q99ME6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Atp1b4Q99ME6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Atp1b4Q99ME6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Atp1b4Q99ME6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Atp1b4Q99ME6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Atp1b4Q99ME6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Atp1b4Q99ME6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Atp1b4Q99ME6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Atp1b4Q99ME6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Atp1b4Q99ME6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Atp1b4Q99ME6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Atp1b4Q99ME6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Atp1b4Q99ME6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Atp1b4Q99ME6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
Atp1b4Q99ME6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Atp1b4Q99ME6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Atp1b4Q99ME6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Atp1b4Q99ME6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Atp1b4Q99ME6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms