Protein–RNA interactions for Protein: Q99M74

Krt82, Keratin, type II cuticular Hb2, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt82Q99M74 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt82Q99M74 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt82Q99M74 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt82Q99M74 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt82Q99M74 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt82Q99M74 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt82Q99M74 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt82Q99M74 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt82Q99M74 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt82Q99M74 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt82Q99M74 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt82Q99M74 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt82Q99M74 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt82Q99M74 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt82Q99M74 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt82Q99M74 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt82Q99M74 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt82Q99M74 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt82Q99M74 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt82Q99M74 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt82Q99M74 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt82Q99M74 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt82Q99M74 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt82Q99M74 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt82Q99M74 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt82Q99M74 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt82Q99M74 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt82Q99M74 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt82Q99M74 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt82Q99M74 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt82Q99M74 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt82Q99M74 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt82Q99M74 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt82Q99M74 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt82Q99M74 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt82Q99M74 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt82Q99M74 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt82Q99M74 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt82Q99M74 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt82Q99M74 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt82Q99M74 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt82Q99M74 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt82Q99M74 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt82Q99M74 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt82Q99M74 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt82Q99M74 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt82Q99M74 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt82Q99M74 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt82Q99M74 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt82Q99M74 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt82Q99M74 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt82Q99M74 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt82Q99M74 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt82Q99M74 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt82Q99M74 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt82Q99M74 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt82Q99M74 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt82Q99M74 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt82Q99M74 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt82Q99M74 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt82Q99M74 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt82Q99M74 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt82Q99M74 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt82Q99M74 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt82Q99M74 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt82Q99M74 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt82Q99M74 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt82Q99M74 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt82Q99M74 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt82Q99M74 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt82Q99M74 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt82Q99M74 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt82Q99M74 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt82Q99M74 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt82Q99M74 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt82Q99M74 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt82Q99M74 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt82Q99M74 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt82Q99M74 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt82Q99M74 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt82Q99M74 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt82Q99M74 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt82Q99M74 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt82Q99M74 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt82Q99M74 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt82Q99M74 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt82Q99M74 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt82Q99M74 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt82Q99M74 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt82Q99M74 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt82Q99M74 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt82Q99M74 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt82Q99M74 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt82Q99M74 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt82Q99M74 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt82Q99M74 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt82Q99M74 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt82Q99M74 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt82Q99M74 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt82Q99M74 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms