Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU8

Uncharacterized protein C6orf62 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99LU8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q99LU8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q99LU8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q99LU8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q99LU8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q99LU8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q99LU8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q99LU8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q99LU8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Q99LU8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q99LU8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q99LU8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q99LU8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q99LU8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q99LU8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q99LU8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q99LU8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q99LU8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q99LU8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q99LU8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q99LU8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q99LU8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q99LU8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q99LU8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q99LU8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q99LU8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q99LU8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q99LU8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q99LU8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q99LU8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q99LU8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q99LU8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q99LU8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Q99LU8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q99LU8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q99LU8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q99LU8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q99LU8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q99LU8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q99LU8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q99LU8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q99LU8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q99LU8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q99LU8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q99LU8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q99LU8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q99LU8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q99LU8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q99LU8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q99LU8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q99LU8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q99LU8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q99LU8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q99LU8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q99LU8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q99LU8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q99LU8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q99LU8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q99LU8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q99LU8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q99LU8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q99LU8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q99LU8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q99LU8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q99LU8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q99LU8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q99LU8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q99LU8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q99LU8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q99LU8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q99LU8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q99LU8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q99LU8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q99LU8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q99LU8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q99LU8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q99LU8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q99LU8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q99LU8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q99LU8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q99LU8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q99LU8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q99LU8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q99LU8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q99LU8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q99LU8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q99LU8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q99LU8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q99LU8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q99LU8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q99LU8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q99LU8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q99LU8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q99LU8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q99LU8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q99LU8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q99LU8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q99LU8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q99LU8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q99LU8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms