Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cstf3Q99LI7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cstf3Q99LI7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cstf3Q99LI7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cstf3Q99LI7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cstf3Q99LI7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Cstf3Q99LI7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cstf3Q99LI7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cstf3Q99LI7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cstf3Q99LI7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cstf3Q99LI7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cstf3Q99LI7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cstf3Q99LI7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cstf3Q99LI7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cstf3Q99LI7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cstf3Q99LI7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cstf3Q99LI7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cstf3Q99LI7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cstf3Q99LI7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cstf3Q99LI7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cstf3Q99LI7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cstf3Q99LI7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cstf3Q99LI7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cstf3Q99LI7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cstf3Q99LI7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Cstf3Q99LI7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cstf3Q99LI7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cstf3Q99LI7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cstf3Q99LI7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cstf3Q99LI7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cstf3Q99LI7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cstf3Q99LI7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cstf3Q99LI7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cstf3Q99LI7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cstf3Q99LI7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cstf3Q99LI7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms