Protein–RNA interactions for Protein: Q99L43

Cds2, Phosphatidate cytidylyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds2Q99L43 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cds2Q99L43 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cds2Q99L43 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cds2Q99L43 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cds2Q99L43 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cds2Q99L43 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cds2Q99L43 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cds2Q99L43 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cds2Q99L43 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cds2Q99L43 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cds2Q99L43 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cds2Q99L43 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cds2Q99L43 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cds2Q99L43 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cds2Q99L43 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cds2Q99L43 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cds2Q99L43 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cds2Q99L43 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cds2Q99L43 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cds2Q99L43 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cds2Q99L43 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cds2Q99L43 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cds2Q99L43 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cds2Q99L43 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cds2Q99L43 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Cds2Q99L43 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cds2Q99L43 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cds2Q99L43 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cds2Q99L43 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cds2Q99L43 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms