Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubxn2aQ99KJ0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubxn2aQ99KJ0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubxn2aQ99KJ0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubxn2aQ99KJ0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubxn2aQ99KJ0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubxn2aQ99KJ0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubxn2aQ99KJ0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn2aQ99KJ0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn2aQ99KJ0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn2aQ99KJ0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn2aQ99KJ0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn2aQ99KJ0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn2aQ99KJ0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn2aQ99KJ0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn2aQ99KJ0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn2aQ99KJ0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubxn2aQ99KJ0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubxn2aQ99KJ0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubxn2aQ99KJ0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubxn2aQ99KJ0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubxn2aQ99KJ0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubxn2aQ99KJ0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubxn2aQ99KJ0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubxn2aQ99KJ0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubxn2aQ99KJ0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubxn2aQ99KJ0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubxn2aQ99KJ0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubxn2aQ99KJ0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubxn2aQ99KJ0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubxn2aQ99KJ0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubxn2aQ99KJ0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubxn2aQ99KJ0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubxn2aQ99KJ0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubxn2aQ99KJ0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubxn2aQ99KJ0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubxn2aQ99KJ0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubxn2aQ99KJ0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubxn2aQ99KJ0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubxn2aQ99KJ0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubxn2aQ99KJ0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubxn2aQ99KJ0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubxn2aQ99KJ0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubxn2aQ99KJ0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubxn2aQ99KJ0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubxn2aQ99KJ0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubxn2aQ99KJ0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Ubxn2aQ99KJ0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubxn2aQ99KJ0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubxn2aQ99KJ0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubxn2aQ99KJ0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubxn2aQ99KJ0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubxn2aQ99KJ0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubxn2aQ99KJ0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubxn2aQ99KJ0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubxn2aQ99KJ0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubxn2aQ99KJ0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubxn2aQ99KJ0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubxn2aQ99KJ0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubxn2aQ99KJ0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubxn2aQ99KJ0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubxn2aQ99KJ0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubxn2aQ99KJ0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubxn2aQ99KJ0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubxn2aQ99KJ0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn2aQ99KJ0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn2aQ99KJ0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn2aQ99KJ0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn2aQ99KJ0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn2aQ99KJ0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn2aQ99KJ0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn2aQ99KJ0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn2aQ99KJ0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn2aQ99KJ0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn2aQ99KJ0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn2aQ99KJ0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn2aQ99KJ0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn2aQ99KJ0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubxn2aQ99KJ0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubxn2aQ99KJ0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubxn2aQ99KJ0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubxn2aQ99KJ0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubxn2aQ99KJ0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubxn2aQ99KJ0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubxn2aQ99KJ0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ubxn2aQ99KJ0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubxn2aQ99KJ0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms