Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hps4Q99KG7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hps4Q99KG7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hps4Q99KG7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hps4Q99KG7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hps4Q99KG7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hps4Q99KG7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hps4Q99KG7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hps4Q99KG7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hps4Q99KG7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hps4Q99KG7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hps4Q99KG7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Hps4Q99KG7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hps4Q99KG7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hps4Q99KG7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hps4Q99KG7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hps4Q99KG7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hps4Q99KG7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hps4Q99KG7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Hps4Q99KG7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hps4Q99KG7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hps4Q99KG7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hps4Q99KG7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hps4Q99KG7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Hps4Q99KG7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hps4Q99KG7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hps4Q99KG7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hps4Q99KG7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hps4Q99KG7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hps4Q99KG7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hps4Q99KG7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hps4Q99KG7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hps4Q99KG7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hps4Q99KG7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hps4Q99KG7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hps4Q99KG7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hps4Q99KG7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hps4Q99KG7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hps4Q99KG7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hps4Q99KG7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hps4Q99KG7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Hps4Q99KG7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hps4Q99KG7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hps4Q99KG7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms