Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Higd1bQ99JY6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Higd1bQ99JY6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Higd1bQ99JY6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Higd1bQ99JY6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Higd1bQ99JY6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Higd1bQ99JY6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Higd1bQ99JY6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Higd1bQ99JY6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Higd1bQ99JY6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Higd1bQ99JY6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Higd1bQ99JY6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Higd1bQ99JY6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Higd1bQ99JY6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Higd1bQ99JY6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Higd1bQ99JY6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Higd1bQ99JY6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Higd1bQ99JY6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Higd1bQ99JY6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Higd1bQ99JY6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Higd1bQ99JY6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Higd1bQ99JY6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Higd1bQ99JY6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Higd1bQ99JY6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Higd1bQ99JY6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Higd1bQ99JY6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Higd1bQ99JY6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Higd1bQ99JY6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Higd1bQ99JY6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms