Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddb2Q99J79 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ddb2Q99J79 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddb2Q99J79 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms