Protein–RNA interactions for Protein: Q99J56

Derl1, Derlin-1, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl1Q99J56 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Derl1Q99J56 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Derl1Q99J56 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms