Protein–RNA interactions for Protein: Q99J23

Ghdc, GH3 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GhdcQ99J23 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GhdcQ99J23 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GhdcQ99J23 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GhdcQ99J23 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GhdcQ99J23 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GhdcQ99J23 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GhdcQ99J23 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GhdcQ99J23 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GhdcQ99J23 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GhdcQ99J23 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GhdcQ99J23 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GhdcQ99J23 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GhdcQ99J23 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GhdcQ99J23 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GhdcQ99J23 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GhdcQ99J23 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GhdcQ99J23 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GhdcQ99J23 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GhdcQ99J23 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GhdcQ99J23 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GhdcQ99J23 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GhdcQ99J23 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GhdcQ99J23 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GhdcQ99J23 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GhdcQ99J23 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GhdcQ99J23 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GhdcQ99J23 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GhdcQ99J23 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GhdcQ99J23 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GhdcQ99J23 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GhdcQ99J23 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GhdcQ99J23 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GhdcQ99J23 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GhdcQ99J23 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GhdcQ99J23 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GhdcQ99J23 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GhdcQ99J23 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GhdcQ99J23 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GhdcQ99J23 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GhdcQ99J23 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GhdcQ99J23 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GhdcQ99J23 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GhdcQ99J23 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GhdcQ99J23 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GhdcQ99J23 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GhdcQ99J23 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GhdcQ99J23 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GhdcQ99J23 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GhdcQ99J23 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GhdcQ99J23 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GhdcQ99J23 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GhdcQ99J23 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GhdcQ99J23 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GhdcQ99J23 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GhdcQ99J23 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GhdcQ99J23 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GhdcQ99J23 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GhdcQ99J23 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GhdcQ99J23 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GhdcQ99J23 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GhdcQ99J23 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GhdcQ99J23 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GhdcQ99J23 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GhdcQ99J23 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GhdcQ99J23 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GhdcQ99J23 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GhdcQ99J23 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GhdcQ99J23 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GhdcQ99J23 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GhdcQ99J23 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GhdcQ99J23 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GhdcQ99J23 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GhdcQ99J23 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.5 ms