Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smim11aQ99J19 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smim11aQ99J19 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms