Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctu1Q99J10 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctu1Q99J10 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctu1Q99J10 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctu1Q99J10 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctu1Q99J10 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctu1Q99J10 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctu1Q99J10 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctu1Q99J10 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctu1Q99J10 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctu1Q99J10 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctu1Q99J10 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctu1Q99J10 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctu1Q99J10 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctu1Q99J10 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctu1Q99J10 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctu1Q99J10 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctu1Q99J10 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctu1Q99J10 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctu1Q99J10 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctu1Q99J10 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctu1Q99J10 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctu1Q99J10 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctu1Q99J10 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctu1Q99J10 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctu1Q99J10 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctu1Q99J10 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctu1Q99J10 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctu1Q99J10 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctu1Q99J10 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctu1Q99J10 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctu1Q99J10 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctu1Q99J10 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctu1Q99J10 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctu1Q99J10 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctu1Q99J10 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctu1Q99J10 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctu1Q99J10 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctu1Q99J10 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctu1Q99J10 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ctu1Q99J10 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ctu1Q99J10 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctu1Q99J10 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctu1Q99J10 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctu1Q99J10 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctu1Q99J10 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctu1Q99J10 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctu1Q99J10 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctu1Q99J10 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctu1Q99J10 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctu1Q99J10 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctu1Q99J10 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctu1Q99J10 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctu1Q99J10 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctu1Q99J10 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctu1Q99J10 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctu1Q99J10 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctu1Q99J10 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctu1Q99J10 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctu1Q99J10 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctu1Q99J10 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctu1Q99J10 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctu1Q99J10 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctu1Q99J10 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctu1Q99J10 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctu1Q99J10 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctu1Q99J10 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctu1Q99J10 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctu1Q99J10 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctu1Q99J10 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctu1Q99J10 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctu1Q99J10 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctu1Q99J10 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctu1Q99J10 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctu1Q99J10 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctu1Q99J10 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctu1Q99J10 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctu1Q99J10 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctu1Q99J10 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctu1Q99J10 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctu1Q99J10 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctu1Q99J10 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctu1Q99J10 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctu1Q99J10 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctu1Q99J10 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.4 ms