Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Slc8b1Q925Q3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98 ms