Protein–RNA interactions for Protein: Q924T3

Xrcc4, DNA repair protein XRCC4, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc4Q924T3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Xrcc4Q924T3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Xrcc4Q924T3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Xrcc4Q924T3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Xrcc4Q924T3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Xrcc4Q924T3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Xrcc4Q924T3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Xrcc4Q924T3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Xrcc4Q924T3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Xrcc4Q924T3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Xrcc4Q924T3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Xrcc4Q924T3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Xrcc4Q924T3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Xrcc4Q924T3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Xrcc4Q924T3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Xrcc4Q924T3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Xrcc4Q924T3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Xrcc4Q924T3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Xrcc4Q924T3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Xrcc4Q924T3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Xrcc4Q924T3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Xrcc4Q924T3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Xrcc4Q924T3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Xrcc4Q924T3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Xrcc4Q924T3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Xrcc4Q924T3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Xrcc4Q924T3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Xrcc4Q924T3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Xrcc4Q924T3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Xrcc4Q924T3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Xrcc4Q924T3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xrcc4Q924T3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xrcc4Q924T3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xrcc4Q924T3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xrcc4Q924T3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xrcc4Q924T3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xrcc4Q924T3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xrcc4Q924T3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xrcc4Q924T3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Xrcc4Q924T3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Xrcc4Q924T3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Xrcc4Q924T3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Xrcc4Q924T3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Xrcc4Q924T3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Xrcc4Q924T3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Xrcc4Q924T3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Xrcc4Q924T3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Xrcc4Q924T3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Xrcc4Q924T3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Xrcc4Q924T3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Xrcc4Q924T3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Xrcc4Q924T3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Xrcc4Q924T3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Xrcc4Q924T3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Xrcc4Q924T3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Xrcc4Q924T3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Xrcc4Q924T3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Xrcc4Q924T3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Xrcc4Q924T3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Xrcc4Q924T3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Xrcc4Q924T3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Xrcc4Q924T3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Xrcc4Q924T3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Xrcc4Q924T3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Xrcc4Q924T3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Xrcc4Q924T3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Xrcc4Q924T3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms