Protein–RNA interactions for Protein: Q922I5

Foxi1, Forkhead box protein I1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxi1Q922I5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxi1Q922I5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxi1Q922I5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxi1Q922I5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxi1Q922I5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxi1Q922I5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxi1Q922I5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Foxi1Q922I5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Foxi1Q922I5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms