Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD4

Vangl2, Vang-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vangl2Q91ZD4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Vangl2Q91ZD4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vangl2Q91ZD4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vangl2Q91ZD4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vangl2Q91ZD4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vangl2Q91ZD4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vangl2Q91ZD4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vangl2Q91ZD4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vangl2Q91ZD4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vangl2Q91ZD4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vangl2Q91ZD4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vangl2Q91ZD4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vangl2Q91ZD4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vangl2Q91ZD4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vangl2Q91ZD4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Vangl2Q91ZD4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vangl2Q91ZD4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vangl2Q91ZD4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vangl2Q91ZD4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vangl2Q91ZD4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vangl2Q91ZD4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vangl2Q91ZD4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vangl2Q91ZD4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Vangl2Q91ZD4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vangl2Q91ZD4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vangl2Q91ZD4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vangl2Q91ZD4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vangl2Q91ZD4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vangl2Q91ZD4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vangl2Q91ZD4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vangl2Q91ZD4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vangl2Q91ZD4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vangl2Q91ZD4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vangl2Q91ZD4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vangl2Q91ZD4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vangl2Q91ZD4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vangl2Q91ZD4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vangl2Q91ZD4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vangl2Q91ZD4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vangl2Q91ZD4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vangl2Q91ZD4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vangl2Q91ZD4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vangl2Q91ZD4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vangl2Q91ZD4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vangl2Q91ZD4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Vangl2Q91ZD4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vangl2Q91ZD4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms