Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atpaf2Q91YY4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atpaf2Q91YY4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atpaf2Q91YY4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atpaf2Q91YY4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atpaf2Q91YY4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atpaf2Q91YY4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atpaf2Q91YY4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atpaf2Q91YY4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atpaf2Q91YY4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atpaf2Q91YY4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Atpaf2Q91YY4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atpaf2Q91YY4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atpaf2Q91YY4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atpaf2Q91YY4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atpaf2Q91YY4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atpaf2Q91YY4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atpaf2Q91YY4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atpaf2Q91YY4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atpaf2Q91YY4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atpaf2Q91YY4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atpaf2Q91YY4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atpaf2Q91YY4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atpaf2Q91YY4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atpaf2Q91YY4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atpaf2Q91YY4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atpaf2Q91YY4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atpaf2Q91YY4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atpaf2Q91YY4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atpaf2Q91YY4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atpaf2Q91YY4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atpaf2Q91YY4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atpaf2Q91YY4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atpaf2Q91YY4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atpaf2Q91YY4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atpaf2Q91YY4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atpaf2Q91YY4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atpaf2Q91YY4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atpaf2Q91YY4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atpaf2Q91YY4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atpaf2Q91YY4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atpaf2Q91YY4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atpaf2Q91YY4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atpaf2Q91YY4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atpaf2Q91YY4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atpaf2Q91YY4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atpaf2Q91YY4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atpaf2Q91YY4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atpaf2Q91YY4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atpaf2Q91YY4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atpaf2Q91YY4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atpaf2Q91YY4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atpaf2Q91YY4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atpaf2Q91YY4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atpaf2Q91YY4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atpaf2Q91YY4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atpaf2Q91YY4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Atpaf2Q91YY4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atpaf2Q91YY4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atpaf2Q91YY4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atpaf2Q91YY4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atpaf2Q91YY4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atpaf2Q91YY4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atpaf2Q91YY4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atpaf2Q91YY4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atpaf2Q91YY4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atpaf2Q91YY4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atpaf2Q91YY4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atpaf2Q91YY4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Atpaf2Q91YY4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atpaf2Q91YY4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atpaf2Q91YY4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atpaf2Q91YY4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atpaf2Q91YY4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atpaf2Q91YY4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atpaf2Q91YY4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atpaf2Q91YY4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atpaf2Q91YY4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atpaf2Q91YY4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atpaf2Q91YY4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atpaf2Q91YY4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atpaf2Q91YY4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atpaf2Q91YY4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atpaf2Q91YY4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atpaf2Q91YY4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atpaf2Q91YY4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atpaf2Q91YY4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atpaf2Q91YY4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atpaf2Q91YY4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atpaf2Q91YY4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atpaf2Q91YY4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atpaf2Q91YY4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atpaf2Q91YY4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atpaf2Q91YY4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atpaf2Q91YY4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atpaf2Q91YY4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atpaf2Q91YY4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atpaf2Q91YY4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atpaf2Q91YY4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atpaf2Q91YY4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms