Protein–RNA interactions for Protein: Q91WG3

Trub2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Trub2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trub2Q91WG3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trub2Q91WG3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trub2Q91WG3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms