Protein–RNA interactions for Protein: Q91WD4

UPF0415 protein C7orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q91WD4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q91WD4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q91WD4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Q91WD4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q91WD4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q91WD4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q91WD4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q91WD4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q91WD4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q91WD4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q91WD4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q91WD4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q91WD4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q91WD4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q91WD4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q91WD4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q91WD4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q91WD4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Q91WD4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Q91WD4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Q91WD4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Q91WD4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q91WD4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q91WD4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q91WD4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q91WD4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q91WD4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q91WD4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q91WD4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q91WD4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q91WD4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q91WD4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q91WD4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q91WD4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q91WD4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q91WD4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q91WD4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q91WD4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q91WD4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q91WD4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q91WD4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q91WD4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Q91WD4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q91WD4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q91WD4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Q91WD4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Q91WD4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Q91WD4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Q91WD4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q91WD4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q91WD4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q91WD4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q91WD4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q91WD4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q91WD4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q91WD4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q91WD4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q91WD4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q91WD4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q91WD4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q91WD4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q91WD4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q91WD4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q91WD4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q91WD4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q91WD4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q91WD4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q91WD4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q91WD4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q91WD4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q91WD4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q91WD4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q91WD4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q91WD4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q91WD4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q91WD4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q91WD4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q91WD4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q91WD4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q91WD4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q91WD4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q91WD4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q91WD4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q91WD4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q91WD4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q91WD4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q91WD4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q91WD4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q91WD4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q91WD4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q91WD4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q91WD4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q91WD4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q91WD4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q91WD4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q91WD4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q91WD4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q91WD4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q91WD4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q91WD4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 429.7 ms