Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tdrd3Q91W18 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tdrd3Q91W18 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tdrd3Q91W18 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tdrd3Q91W18 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms