Protein–RNA interactions for Protein: Q91VF6

Col26a1, Collagen alpha-1(XXVI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col26a1Q91VF6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col26a1Q91VF6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col26a1Q91VF6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col26a1Q91VF6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col26a1Q91VF6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col26a1Q91VF6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Col26a1Q91VF6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col26a1Q91VF6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Col26a1Q91VF6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col26a1Q91VF6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Col26a1Q91VF6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col26a1Q91VF6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col26a1Q91VF6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col26a1Q91VF6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col26a1Q91VF6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col26a1Q91VF6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col26a1Q91VF6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col26a1Q91VF6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col26a1Q91VF6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col26a1Q91VF6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col26a1Q91VF6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col26a1Q91VF6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col26a1Q91VF6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col26a1Q91VF6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col26a1Q91VF6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Col26a1Q91VF6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col26a1Q91VF6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Col26a1Q91VF6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col26a1Q91VF6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col26a1Q91VF6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col26a1Q91VF6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col26a1Q91VF6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col26a1Q91VF6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col26a1Q91VF6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col26a1Q91VF6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col26a1Q91VF6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col26a1Q91VF6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col26a1Q91VF6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col26a1Q91VF6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col26a1Q91VF6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col26a1Q91VF6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col26a1Q91VF6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col26a1Q91VF6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col26a1Q91VF6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col26a1Q91VF6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col26a1Q91VF6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Col26a1Q91VF6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Col26a1Q91VF6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col26a1Q91VF6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col26a1Q91VF6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col26a1Q91VF6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col26a1Q91VF6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col26a1Q91VF6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col26a1Q91VF6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col26a1Q91VF6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col26a1Q91VF6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col26a1Q91VF6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col26a1Q91VF6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col26a1Q91VF6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col26a1Q91VF6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Col26a1Q91VF6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col26a1Q91VF6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col26a1Q91VF6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col26a1Q91VF6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col26a1Q91VF6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col26a1Q91VF6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col26a1Q91VF6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col26a1Q91VF6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col26a1Q91VF6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Col26a1Q91VF6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col26a1Q91VF6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col26a1Q91VF6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col26a1Q91VF6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col26a1Q91VF6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col26a1Q91VF6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col26a1Q91VF6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col26a1Q91VF6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col26a1Q91VF6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col26a1Q91VF6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col26a1Q91VF6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col26a1Q91VF6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col26a1Q91VF6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col26a1Q91VF6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col26a1Q91VF6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col26a1Q91VF6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col26a1Q91VF6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col26a1Q91VF6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col26a1Q91VF6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col26a1Q91VF6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col26a1Q91VF6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col26a1Q91VF6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Col26a1Q91VF6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col26a1Q91VF6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col26a1Q91VF6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col26a1Q91VF6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col26a1Q91VF6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col26a1Q91VF6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col26a1Q91VF6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col26a1Q91VF6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Col26a1Q91VF6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms