Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI88

Odf4, Outer dense fiber protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf4Q8VI88 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Odf4Q8VI88 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Odf4Q8VI88 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms