Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc71Q8VEG0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc71Q8VEG0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc71Q8VEG0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc71Q8VEG0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc71Q8VEG0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc71Q8VEG0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc71Q8VEG0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc71Q8VEG0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc71Q8VEG0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc71Q8VEG0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc71Q8VEG0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc71Q8VEG0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc71Q8VEG0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc71Q8VEG0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc71Q8VEG0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc71Q8VEG0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc71Q8VEG0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc71Q8VEG0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc71Q8VEG0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc71Q8VEG0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc71Q8VEG0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc71Q8VEG0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc71Q8VEG0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc71Q8VEG0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc71Q8VEG0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc71Q8VEG0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc71Q8VEG0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc71Q8VEG0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc71Q8VEG0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc71Q8VEG0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc71Q8VEG0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc71Q8VEG0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc71Q8VEG0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc71Q8VEG0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc71Q8VEG0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc71Q8VEG0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc71Q8VEG0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc71Q8VEG0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc71Q8VEG0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc71Q8VEG0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc71Q8VEG0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc71Q8VEG0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc71Q8VEG0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc71Q8VEG0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc71Q8VEG0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc71Q8VEG0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc71Q8VEG0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc71Q8VEG0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc71Q8VEG0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc71Q8VEG0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc71Q8VEG0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc71Q8VEG0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc71Q8VEG0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc71Q8VEG0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc71Q8VEG0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc71Q8VEG0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc71Q8VEG0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc71Q8VEG0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc71Q8VEG0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc71Q8VEG0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc71Q8VEG0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc71Q8VEG0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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