Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCN6

Cd99, CD99 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd99Q8VCN6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd99Q8VCN6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd99Q8VCN6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd99Q8VCN6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd99Q8VCN6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Cd99Q8VCN6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd99Q8VCN6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd99Q8VCN6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd99Q8VCN6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd99Q8VCN6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd99Q8VCN6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd99Q8VCN6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd99Q8VCN6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd99Q8VCN6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd99Q8VCN6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd99Q8VCN6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd99Q8VCN6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd99Q8VCN6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd99Q8VCN6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd99Q8VCN6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd99Q8VCN6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd99Q8VCN6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd99Q8VCN6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd99Q8VCN6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd99Q8VCN6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd99Q8VCN6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd99Q8VCN6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd99Q8VCN6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd99Q8VCN6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd99Q8VCN6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd99Q8VCN6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd99Q8VCN6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd99Q8VCN6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd99Q8VCN6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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