Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Top1mtQ8R4U6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top1mtQ8R4U6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top1mtQ8R4U6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top1mtQ8R4U6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top1mtQ8R4U6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top1mtQ8R4U6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top1mtQ8R4U6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top1mtQ8R4U6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Top1mtQ8R4U6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Top1mtQ8R4U6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Top1mtQ8R4U6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Top1mtQ8R4U6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Top1mtQ8R4U6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Top1mtQ8R4U6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top1mtQ8R4U6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top1mtQ8R4U6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top1mtQ8R4U6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top1mtQ8R4U6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Top1mtQ8R4U6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top1mtQ8R4U6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top1mtQ8R4U6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top1mtQ8R4U6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top1mtQ8R4U6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Top1mtQ8R4U6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top1mtQ8R4U6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top1mtQ8R4U6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top1mtQ8R4U6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top1mtQ8R4U6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top1mtQ8R4U6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top1mtQ8R4U6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Top1mtQ8R4U6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Top1mtQ8R4U6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Top1mtQ8R4U6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Top1mtQ8R4U6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Top1mtQ8R4U6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Top1mtQ8R4U6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Top1mtQ8R4U6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Top1mtQ8R4U6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Top1mtQ8R4U6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Top1mtQ8R4U6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Top1mtQ8R4U6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Top1mtQ8R4U6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Top1mtQ8R4U6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Top1mtQ8R4U6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Top1mtQ8R4U6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Top1mtQ8R4U6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Top1mtQ8R4U6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Top1mtQ8R4U6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Top1mtQ8R4U6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Top1mtQ8R4U6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Top1mtQ8R4U6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Top1mtQ8R4U6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Top1mtQ8R4U6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Top1mtQ8R4U6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Top1mtQ8R4U6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Top1mtQ8R4U6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Top1mtQ8R4U6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Top1mtQ8R4U6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Top1mtQ8R4U6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Top1mtQ8R4U6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Top1mtQ8R4U6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Top1mtQ8R4U6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Top1mtQ8R4U6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Top1mtQ8R4U6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Top1mtQ8R4U6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Top1mtQ8R4U6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
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Top1mtQ8R4U6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Top1mtQ8R4U6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Top1mtQ8R4U6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Top1mtQ8R4U6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Top1mtQ8R4U6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Top1mtQ8R4U6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Top1mtQ8R4U6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Top1mtQ8R4U6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Top1mtQ8R4U6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top1mtQ8R4U6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top1mtQ8R4U6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top1mtQ8R4U6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top1mtQ8R4U6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top1mtQ8R4U6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top1mtQ8R4U6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top1mtQ8R4U6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top1mtQ8R4U6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Top1mtQ8R4U6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Top1mtQ8R4U6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Top1mtQ8R4U6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Top1mtQ8R4U6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Top1mtQ8R4U6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Top1mtQ8R4U6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Top1mtQ8R4U6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Top1mtQ8R4U6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Top1mtQ8R4U6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Top1mtQ8R4U6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Top1mtQ8R4U6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Top1mtQ8R4U6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Top1mtQ8R4U6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Top1mtQ8R4U6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Top1mtQ8R4U6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
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