Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc58Q8R3Q6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc58Q8R3Q6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc58Q8R3Q6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc58Q8R3Q6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc58Q8R3Q6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms