Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3F9

Tut1, Speckle targeted PIP5K1A-regulated poly(A) polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tut1Q8R3F9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tut1Q8R3F9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tut1Q8R3F9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tut1Q8R3F9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tut1Q8R3F9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tut1Q8R3F9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tut1Q8R3F9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tut1Q8R3F9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tut1Q8R3F9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tut1Q8R3F9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tut1Q8R3F9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tut1Q8R3F9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tut1Q8R3F9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tut1Q8R3F9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tut1Q8R3F9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tut1Q8R3F9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tut1Q8R3F9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tut1Q8R3F9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tut1Q8R3F9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tut1Q8R3F9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tut1Q8R3F9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tut1Q8R3F9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tut1Q8R3F9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tut1Q8R3F9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tut1Q8R3F9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tut1Q8R3F9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tut1Q8R3F9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tut1Q8R3F9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tut1Q8R3F9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tut1Q8R3F9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tut1Q8R3F9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tut1Q8R3F9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tut1Q8R3F9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tut1Q8R3F9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tut1Q8R3F9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tut1Q8R3F9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tut1Q8R3F9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tut1Q8R3F9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tut1Q8R3F9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tut1Q8R3F9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tut1Q8R3F9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tut1Q8R3F9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tut1Q8R3F9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tut1Q8R3F9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tut1Q8R3F9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tut1Q8R3F9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tut1Q8R3F9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tut1Q8R3F9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tut1Q8R3F9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tut1Q8R3F9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tut1Q8R3F9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tut1Q8R3F9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tut1Q8R3F9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tut1Q8R3F9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tut1Q8R3F9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tut1Q8R3F9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Tut1Q8R3F9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tut1Q8R3F9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tut1Q8R3F9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Tut1Q8R3F9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tut1Q8R3F9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tut1Q8R3F9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tut1Q8R3F9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tut1Q8R3F9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tut1Q8R3F9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tut1Q8R3F9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tut1Q8R3F9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tut1Q8R3F9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Tut1Q8R3F9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tut1Q8R3F9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tut1Q8R3F9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tut1Q8R3F9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tut1Q8R3F9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Tut1Q8R3F9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tut1Q8R3F9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tut1Q8R3F9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tut1Q8R3F9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tut1Q8R3F9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tut1Q8R3F9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tut1Q8R3F9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Tut1Q8R3F9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tut1Q8R3F9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tut1Q8R3F9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tut1Q8R3F9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tut1Q8R3F9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tut1Q8R3F9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tut1Q8R3F9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tut1Q8R3F9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tut1Q8R3F9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tut1Q8R3F9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tut1Q8R3F9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tut1Q8R3F9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tut1Q8R3F9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tut1Q8R3F9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Tut1Q8R3F9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tut1Q8R3F9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tut1Q8R3F9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tut1Q8R3F9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tut1Q8R3F9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tut1Q8R3F9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms