Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rdh16f2Q8K3M1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rdh16f2Q8K3M1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rdh16f2Q8K3M1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rdh16f2Q8K3M1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rdh16f2Q8K3M1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rdh16f2Q8K3M1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rdh16f2Q8K3M1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rdh16f2Q8K3M1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rdh16f2Q8K3M1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rdh16f2Q8K3M1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rdh16f2Q8K3M1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rdh16f2Q8K3M1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rdh16f2Q8K3M1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rdh16f2Q8K3M1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rdh16f2Q8K3M1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rdh16f2Q8K3M1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rdh16f2Q8K3M1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rdh16f2Q8K3M1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rdh16f2Q8K3M1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Rdh16f2Q8K3M1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rdh16f2Q8K3M1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rdh16f2Q8K3M1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rdh16f2Q8K3M1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rdh16f2Q8K3M1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rdh16f2Q8K3M1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rdh16f2Q8K3M1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rdh16f2Q8K3M1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rdh16f2Q8K3M1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rdh16f2Q8K3M1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms