Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MyripQ8K3I4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MyripQ8K3I4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MyripQ8K3I4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MyripQ8K3I4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MyripQ8K3I4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MyripQ8K3I4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MyripQ8K3I4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MyripQ8K3I4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MyripQ8K3I4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MyripQ8K3I4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MyripQ8K3I4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MyripQ8K3I4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MyripQ8K3I4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MyripQ8K3I4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MyripQ8K3I4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MyripQ8K3I4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MyripQ8K3I4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MyripQ8K3I4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MyripQ8K3I4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MyripQ8K3I4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MyripQ8K3I4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MyripQ8K3I4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MyripQ8K3I4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MyripQ8K3I4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MyripQ8K3I4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MyripQ8K3I4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MyripQ8K3I4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MyripQ8K3I4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MyripQ8K3I4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MyripQ8K3I4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MyripQ8K3I4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MyripQ8K3I4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MyripQ8K3I4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MyripQ8K3I4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MyripQ8K3I4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MyripQ8K3I4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MyripQ8K3I4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MyripQ8K3I4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MyripQ8K3I4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MyripQ8K3I4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MyripQ8K3I4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MyripQ8K3I4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MyripQ8K3I4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MyripQ8K3I4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MyripQ8K3I4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MyripQ8K3I4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MyripQ8K3I4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MyripQ8K3I4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MyripQ8K3I4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MyripQ8K3I4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MyripQ8K3I4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MyripQ8K3I4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MyripQ8K3I4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MyripQ8K3I4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MyripQ8K3I4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MyripQ8K3I4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
MyripQ8K3I4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MyripQ8K3I4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms