Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E0

Stx5, Syntaxin-5, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx5Q8K1E0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Stx5Q8K1E0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Stx5Q8K1E0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Stx5Q8K1E0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Stx5Q8K1E0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Stx5Q8K1E0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Stx5Q8K1E0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Stx5Q8K1E0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Stx5Q8K1E0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stx5Q8K1E0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stx5Q8K1E0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stx5Q8K1E0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stx5Q8K1E0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stx5Q8K1E0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stx5Q8K1E0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stx5Q8K1E0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stx5Q8K1E0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stx5Q8K1E0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stx5Q8K1E0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stx5Q8K1E0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stx5Q8K1E0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Stx5Q8K1E0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Stx5Q8K1E0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx5Q8K1E0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx5Q8K1E0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx5Q8K1E0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx5Q8K1E0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx5Q8K1E0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx5Q8K1E0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx5Q8K1E0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx5Q8K1E0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx5Q8K1E0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Stx5Q8K1E0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx5Q8K1E0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx5Q8K1E0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx5Q8K1E0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx5Q8K1E0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx5Q8K1E0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx5Q8K1E0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx5Q8K1E0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx5Q8K1E0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Stx5Q8K1E0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Stx5Q8K1E0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms