Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmbrd1Q8K0B2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmbrd1Q8K0B2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmbrd1Q8K0B2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmbrd1Q8K0B2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmbrd1Q8K0B2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmbrd1Q8K0B2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmbrd1Q8K0B2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmbrd1Q8K0B2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmbrd1Q8K0B2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Lmbrd1Q8K0B2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmbrd1Q8K0B2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmbrd1Q8K0B2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Lmbrd1Q8K0B2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmbrd1Q8K0B2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmbrd1Q8K0B2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmbrd1Q8K0B2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmbrd1Q8K0B2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmbrd1Q8K0B2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmbrd1Q8K0B2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmbrd1Q8K0B2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmbrd1Q8K0B2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmbrd1Q8K0B2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmbrd1Q8K0B2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmbrd1Q8K0B2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmbrd1Q8K0B2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmbrd1Q8K0B2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmbrd1Q8K0B2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmbrd1Q8K0B2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmbrd1Q8K0B2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmbrd1Q8K0B2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmbrd1Q8K0B2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmbrd1Q8K0B2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmbrd1Q8K0B2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmbrd1Q8K0B2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmbrd1Q8K0B2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmbrd1Q8K0B2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmbrd1Q8K0B2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmbrd1Q8K0B2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmbrd1Q8K0B2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lmbrd1Q8K0B2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lmbrd1Q8K0B2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lmbrd1Q8K0B2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lmbrd1Q8K0B2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lmbrd1Q8K0B2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmbrd1Q8K0B2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmbrd1Q8K0B2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmbrd1Q8K0B2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmbrd1Q8K0B2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmbrd1Q8K0B2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmbrd1Q8K0B2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmbrd1Q8K0B2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmbrd1Q8K0B2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmbrd1Q8K0B2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmbrd1Q8K0B2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmbrd1Q8K0B2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmbrd1Q8K0B2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmbrd1Q8K0B2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmbrd1Q8K0B2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmbrd1Q8K0B2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmbrd1Q8K0B2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmbrd1Q8K0B2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmbrd1Q8K0B2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmbrd1Q8K0B2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmbrd1Q8K0B2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmbrd1Q8K0B2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmbrd1Q8K0B2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmbrd1Q8K0B2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmbrd1Q8K0B2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmbrd1Q8K0B2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmbrd1Q8K0B2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmbrd1Q8K0B2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmbrd1Q8K0B2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmbrd1Q8K0B2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmbrd1Q8K0B2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmbrd1Q8K0B2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmbrd1Q8K0B2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmbrd1Q8K0B2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmbrd1Q8K0B2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmbrd1Q8K0B2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmbrd1Q8K0B2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmbrd1Q8K0B2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmbrd1Q8K0B2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmbrd1Q8K0B2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmbrd1Q8K0B2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmbrd1Q8K0B2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmbrd1Q8K0B2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmbrd1Q8K0B2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Lmbrd1Q8K0B2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lmbrd1Q8K0B2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmbrd1Q8K0B2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmbrd1Q8K0B2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmbrd1Q8K0B2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmbrd1Q8K0B2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmbrd1Q8K0B2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmbrd1Q8K0B2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms