Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rasgef1bQ8JZL7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rasgef1bQ8JZL7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rasgef1bQ8JZL7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rasgef1bQ8JZL7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rasgef1bQ8JZL7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rasgef1bQ8JZL7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms