Protein–RNA interactions for Protein: Q8HWB2

H2-Q4, Histocompatibility 2, Q region locus 4, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q4Q8HWB2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2-Q4Q8HWB2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
H2-Q4Q8HWB2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2-Q4Q8HWB2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2-Q4Q8HWB2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2-Q4Q8HWB2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2-Q4Q8HWB2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2-Q4Q8HWB2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2-Q4Q8HWB2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2-Q4Q8HWB2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2-Q4Q8HWB2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2-Q4Q8HWB2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2-Q4Q8HWB2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2-Q4Q8HWB2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2-Q4Q8HWB2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2-Q4Q8HWB2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2-Q4Q8HWB2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2-Q4Q8HWB2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2-Q4Q8HWB2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2-Q4Q8HWB2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2-Q4Q8HWB2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2-Q4Q8HWB2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2-Q4Q8HWB2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2-Q4Q8HWB2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2-Q4Q8HWB2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2-Q4Q8HWB2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2-Q4Q8HWB2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
H2-Q4Q8HWB2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2-Q4Q8HWB2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2-Q4Q8HWB2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2-Q4Q8HWB2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2-Q4Q8HWB2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
H2-Q4Q8HWB2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2-Q4Q8HWB2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2-Q4Q8HWB2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
H2-Q4Q8HWB2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2-Q4Q8HWB2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
H2-Q4Q8HWB2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2-Q4Q8HWB2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-Q4Q8HWB2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-Q4Q8HWB2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-Q4Q8HWB2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-Q4Q8HWB2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-Q4Q8HWB2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-Q4Q8HWB2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-Q4Q8HWB2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-Q4Q8HWB2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-Q4Q8HWB2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-Q4Q8HWB2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-Q4Q8HWB2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
H2-Q4Q8HWB2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2-Q4Q8HWB2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2-Q4Q8HWB2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2-Q4Q8HWB2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2-Q4Q8HWB2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2-Q4Q8HWB2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2-Q4Q8HWB2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2-Q4Q8HWB2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2-Q4Q8HWB2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2-Q4Q8HWB2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2-Q4Q8HWB2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2-Q4Q8HWB2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2-Q4Q8HWB2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2-Q4Q8HWB2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2-Q4Q8HWB2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2-Q4Q8HWB2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2-Q4Q8HWB2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2-Q4Q8HWB2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2-Q4Q8HWB2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2-Q4Q8HWB2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2-Q4Q8HWB2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2-Q4Q8HWB2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2-Q4Q8HWB2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2-Q4Q8HWB2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2-Q4Q8HWB2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2-Q4Q8HWB2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
H2-Q4Q8HWB2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2-Q4Q8HWB2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
H2-Q4Q8HWB2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
H2-Q4Q8HWB2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
H2-Q4Q8HWB2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
H2-Q4Q8HWB2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2-Q4Q8HWB2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2-Q4Q8HWB2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
H2-Q4Q8HWB2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2-Q4Q8HWB2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2-Q4Q8HWB2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2-Q4Q8HWB2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2-Q4Q8HWB2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2-Q4Q8HWB2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2-Q4Q8HWB2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2-Q4Q8HWB2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2-Q4Q8HWB2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2-Q4Q8HWB2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms