Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trip10Q8CJ53 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trip10Q8CJ53 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trip10Q8CJ53 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trip10Q8CJ53 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trip10Q8CJ53 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trip10Q8CJ53 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trip10Q8CJ53 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trip10Q8CJ53 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trip10Q8CJ53 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trip10Q8CJ53 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip10Q8CJ53 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip10Q8CJ53 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip10Q8CJ53 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip10Q8CJ53 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip10Q8CJ53 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip10Q8CJ53 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip10Q8CJ53 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip10Q8CJ53 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip10Q8CJ53 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip10Q8CJ53 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trip10Q8CJ53 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip10Q8CJ53 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip10Q8CJ53 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip10Q8CJ53 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip10Q8CJ53 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip10Q8CJ53 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip10Q8CJ53 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip10Q8CJ53 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip10Q8CJ53 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip10Q8CJ53 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip10Q8CJ53 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip10Q8CJ53 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Trip10Q8CJ53 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip10Q8CJ53 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip10Q8CJ53 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip10Q8CJ53 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip10Q8CJ53 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip10Q8CJ53 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trip10Q8CJ53 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip10Q8CJ53 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip10Q8CJ53 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trip10Q8CJ53 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trip10Q8CJ53 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trip10Q8CJ53 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trip10Q8CJ53 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trip10Q8CJ53 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trip10Q8CJ53 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trip10Q8CJ53 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trip10Q8CJ53 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms