Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT1

Ngef, Ephexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgefQ8CHT1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NgefQ8CHT1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NgefQ8CHT1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NgefQ8CHT1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NgefQ8CHT1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NgefQ8CHT1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NgefQ8CHT1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NgefQ8CHT1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NgefQ8CHT1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NgefQ8CHT1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NgefQ8CHT1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NgefQ8CHT1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NgefQ8CHT1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NgefQ8CHT1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NgefQ8CHT1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NgefQ8CHT1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NgefQ8CHT1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NgefQ8CHT1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NgefQ8CHT1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NgefQ8CHT1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NgefQ8CHT1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NgefQ8CHT1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NgefQ8CHT1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NgefQ8CHT1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NgefQ8CHT1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NgefQ8CHT1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NgefQ8CHT1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NgefQ8CHT1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NgefQ8CHT1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NgefQ8CHT1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NgefQ8CHT1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NgefQ8CHT1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NgefQ8CHT1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NgefQ8CHT1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NgefQ8CHT1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NgefQ8CHT1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NgefQ8CHT1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NgefQ8CHT1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NgefQ8CHT1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NgefQ8CHT1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NgefQ8CHT1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NgefQ8CHT1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NgefQ8CHT1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NgefQ8CHT1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NgefQ8CHT1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NgefQ8CHT1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NgefQ8CHT1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NgefQ8CHT1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NgefQ8CHT1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NgefQ8CHT1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NgefQ8CHT1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NgefQ8CHT1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NgefQ8CHT1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NgefQ8CHT1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NgefQ8CHT1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NgefQ8CHT1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NgefQ8CHT1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NgefQ8CHT1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NgefQ8CHT1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NgefQ8CHT1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NgefQ8CHT1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NgefQ8CHT1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NgefQ8CHT1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NgefQ8CHT1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NgefQ8CHT1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NgefQ8CHT1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NgefQ8CHT1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NgefQ8CHT1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NgefQ8CHT1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NgefQ8CHT1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NgefQ8CHT1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NgefQ8CHT1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NgefQ8CHT1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NgefQ8CHT1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NgefQ8CHT1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NgefQ8CHT1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NgefQ8CHT1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NgefQ8CHT1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NgefQ8CHT1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NgefQ8CHT1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NgefQ8CHT1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NgefQ8CHT1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NgefQ8CHT1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NgefQ8CHT1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NgefQ8CHT1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NgefQ8CHT1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NgefQ8CHT1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NgefQ8CHT1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NgefQ8CHT1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NgefQ8CHT1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NgefQ8CHT1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NgefQ8CHT1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NgefQ8CHT1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NgefQ8CHT1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NgefQ8CHT1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NgefQ8CHT1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NgefQ8CHT1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NgefQ8CHT1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NgefQ8CHT1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NgefQ8CHT1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms