Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH77

Nav1, Neuron navigator 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nav1Q8CH77 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nav1Q8CH77 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Nav1Q8CH77 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nav1Q8CH77 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nav1Q8CH77 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Nav1Q8CH77 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nav1Q8CH77 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nav1Q8CH77 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nav1Q8CH77 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nav1Q8CH77 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nav1Q8CH77 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nav1Q8CH77 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nav1Q8CH77 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nav1Q8CH77 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nav1Q8CH77 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nav1Q8CH77 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Nav1Q8CH77 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nav1Q8CH77 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nav1Q8CH77 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nav1Q8CH77 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Nav1Q8CH77 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nav1Q8CH77 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nav1Q8CH77 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nav1Q8CH77 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nav1Q8CH77 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nav1Q8CH77 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Nav1Q8CH77 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Nav1Q8CH77 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Nav1Q8CH77 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nav1Q8CH77 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nav1Q8CH77 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nav1Q8CH77 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nav1Q8CH77 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nav1Q8CH77 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nav1Q8CH77 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nav1Q8CH77 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nav1Q8CH77 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nav1Q8CH77 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nav1Q8CH77 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nav1Q8CH77 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nav1Q8CH77 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nav1Q8CH77 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Nav1Q8CH77 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nav1Q8CH77 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nav1Q8CH77 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nav1Q8CH77 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nav1Q8CH77 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms