Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm9955Q8CEJ8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm9955Q8CEJ8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm9955Q8CEJ8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm9955Q8CEJ8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm9955Q8CEJ8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm9955Q8CEJ8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm9955Q8CEJ8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm9955Q8CEJ8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm9955Q8CEJ8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm9955Q8CEJ8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm9955Q8CEJ8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm9955Q8CEJ8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm9955Q8CEJ8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm9955Q8CEJ8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm9955Q8CEJ8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm9955Q8CEJ8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm9955Q8CEJ8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm9955Q8CEJ8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm9955Q8CEJ8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm9955Q8CEJ8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm9955Q8CEJ8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm9955Q8CEJ8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm9955Q8CEJ8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm9955Q8CEJ8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm9955Q8CEJ8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm9955Q8CEJ8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm9955Q8CEJ8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm9955Q8CEJ8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm9955Q8CEJ8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm9955Q8CEJ8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm9955Q8CEJ8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Gm9955Q8CEJ8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gm9955Q8CEJ8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Gm9955Q8CEJ8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Gm9955Q8CEJ8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Gm9955Q8CEJ8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Gm9955Q8CEJ8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Gm9955Q8CEJ8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Gm9955Q8CEJ8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Gm9955Q8CEJ8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Gm9955Q8CEJ8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9955Q8CEJ8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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