Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
9030612E09RikQ8CE20 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms