Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc73Q8CDM4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc73Q8CDM4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc73Q8CDM4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc73Q8CDM4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc73Q8CDM4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc73Q8CDM4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc73Q8CDM4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc73Q8CDM4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc73Q8CDM4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc73Q8CDM4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms