Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atad2Q8CDM1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atad2Q8CDM1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Atad2Q8CDM1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atad2Q8CDM1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atad2Q8CDM1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atad2Q8CDM1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atad2Q8CDM1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atad2Q8CDM1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atad2Q8CDM1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atad2Q8CDM1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atad2Q8CDM1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atad2Q8CDM1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atad2Q8CDM1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atad2Q8CDM1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atad2Q8CDM1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atad2Q8CDM1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atad2Q8CDM1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atad2Q8CDM1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Atad2Q8CDM1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atad2Q8CDM1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atad2Q8CDM1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atad2Q8CDM1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atad2Q8CDM1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atad2Q8CDM1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atad2Q8CDM1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atad2Q8CDM1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atad2Q8CDM1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atad2Q8CDM1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atad2Q8CDM1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atad2Q8CDM1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atad2Q8CDM1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atad2Q8CDM1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atad2Q8CDM1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atad2Q8CDM1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Atad2Q8CDM1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atad2Q8CDM1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atad2Q8CDM1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atad2Q8CDM1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atad2Q8CDM1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atad2Q8CDM1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atad2Q8CDM1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atad2Q8CDM1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atad2Q8CDM1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atad2Q8CDM1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atad2Q8CDM1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atad2Q8CDM1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atad2Q8CDM1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Atad2Q8CDM1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atad2Q8CDM1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atad2Q8CDM1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atad2Q8CDM1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atad2Q8CDM1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atad2Q8CDM1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atad2Q8CDM1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atad2Q8CDM1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atad2Q8CDM1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atad2Q8CDM1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atad2Q8CDM1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atad2Q8CDM1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atad2Q8CDM1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atad2Q8CDM1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atad2Q8CDM1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atad2Q8CDM1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atad2Q8CDM1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atad2Q8CDM1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atad2Q8CDM1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atad2Q8CDM1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atad2Q8CDM1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atad2Q8CDM1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Atad2Q8CDM1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atad2Q8CDM1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atad2Q8CDM1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atad2Q8CDM1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atad2Q8CDM1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atad2Q8CDM1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atad2Q8CDM1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atad2Q8CDM1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atad2Q8CDM1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atad2Q8CDM1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atad2Q8CDM1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Atad2Q8CDM1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Atad2Q8CDM1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atad2Q8CDM1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atad2Q8CDM1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atad2Q8CDM1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atad2Q8CDM1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atad2Q8CDM1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atad2Q8CDM1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atad2Q8CDM1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atad2Q8CDM1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atad2Q8CDM1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atad2Q8CDM1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atad2Q8CDM1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atad2Q8CDM1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atad2Q8CDM1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atad2Q8CDM1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Atad2Q8CDM1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atad2Q8CDM1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atad2Q8CDM1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms