Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD15

Riox2, Ribosomal oxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox2Q8CD15 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Riox2Q8CD15 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Riox2Q8CD15 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Riox2Q8CD15 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Riox2Q8CD15 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Riox2Q8CD15 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Riox2Q8CD15 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Riox2Q8CD15 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Riox2Q8CD15 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Riox2Q8CD15 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Riox2Q8CD15 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Riox2Q8CD15 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Riox2Q8CD15 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Riox2Q8CD15 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Riox2Q8CD15 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Riox2Q8CD15 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Riox2Q8CD15 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Riox2Q8CD15 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Riox2Q8CD15 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Riox2Q8CD15 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Riox2Q8CD15 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Riox2Q8CD15 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Riox2Q8CD15 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Riox2Q8CD15 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Riox2Q8CD15 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Riox2Q8CD15 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Riox2Q8CD15 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Riox2Q8CD15 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Riox2Q8CD15 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Riox2Q8CD15 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Riox2Q8CD15 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Riox2Q8CD15 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Riox2Q8CD15 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Riox2Q8CD15 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Riox2Q8CD15 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Riox2Q8CD15 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Riox2Q8CD15 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Riox2Q8CD15 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Riox2Q8CD15 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Riox2Q8CD15 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Riox2Q8CD15 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Riox2Q8CD15 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Riox2Q8CD15 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Riox2Q8CD15 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Riox2Q8CD15 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Riox2Q8CD15 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Riox2Q8CD15 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Riox2Q8CD15 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Riox2Q8CD15 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Riox2Q8CD15 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Riox2Q8CD15 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Riox2Q8CD15 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Riox2Q8CD15 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Riox2Q8CD15 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Riox2Q8CD15 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Riox2Q8CD15 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Riox2Q8CD15 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Riox2Q8CD15 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Riox2Q8CD15 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Riox2Q8CD15 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Riox2Q8CD15 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Riox2Q8CD15 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Riox2Q8CD15 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Riox2Q8CD15 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Riox2Q8CD15 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Riox2Q8CD15 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Riox2Q8CD15 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Riox2Q8CD15 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Riox2Q8CD15 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Riox2Q8CD15 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Riox2Q8CD15 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Riox2Q8CD15 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Riox2Q8CD15 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Riox2Q8CD15 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Riox2Q8CD15 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Riox2Q8CD15 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Riox2Q8CD15 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Riox2Q8CD15 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Riox2Q8CD15 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Riox2Q8CD15 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Riox2Q8CD15 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Riox2Q8CD15 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Riox2Q8CD15 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Riox2Q8CD15 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Riox2Q8CD15 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Riox2Q8CD15 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Riox2Q8CD15 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Riox2Q8CD15 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Riox2Q8CD15 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Riox2Q8CD15 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Riox2Q8CD15 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Riox2Q8CD15 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Riox2Q8CD15 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Riox2Q8CD15 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Riox2Q8CD15 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Riox2Q8CD15 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Riox2Q8CD15 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Riox2Q8CD15 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Riox2Q8CD15 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Riox2Q8CD15 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms