Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ufl1Q8CCJ3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ufl1Q8CCJ3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ufl1Q8CCJ3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ufl1Q8CCJ3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ufl1Q8CCJ3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ufl1Q8CCJ3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ufl1Q8CCJ3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ufl1Q8CCJ3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ufl1Q8CCJ3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ufl1Q8CCJ3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ufl1Q8CCJ3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ufl1Q8CCJ3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ufl1Q8CCJ3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ufl1Q8CCJ3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ufl1Q8CCJ3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ufl1Q8CCJ3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ufl1Q8CCJ3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ufl1Q8CCJ3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ufl1Q8CCJ3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ufl1Q8CCJ3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ufl1Q8CCJ3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ufl1Q8CCJ3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ufl1Q8CCJ3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ufl1Q8CCJ3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ufl1Q8CCJ3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ufl1Q8CCJ3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ufl1Q8CCJ3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ufl1Q8CCJ3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ufl1Q8CCJ3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ufl1Q8CCJ3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ufl1Q8CCJ3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ufl1Q8CCJ3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ufl1Q8CCJ3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ufl1Q8CCJ3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ufl1Q8CCJ3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ufl1Q8CCJ3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ufl1Q8CCJ3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ufl1Q8CCJ3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ufl1Q8CCJ3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ufl1Q8CCJ3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ufl1Q8CCJ3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ufl1Q8CCJ3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ufl1Q8CCJ3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ufl1Q8CCJ3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ufl1Q8CCJ3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ufl1Q8CCJ3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ufl1Q8CCJ3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ufl1Q8CCJ3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ufl1Q8CCJ3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ufl1Q8CCJ3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ufl1Q8CCJ3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ufl1Q8CCJ3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ufl1Q8CCJ3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ufl1Q8CCJ3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ufl1Q8CCJ3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms