Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCF0

Prpf31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf31Q8CCF0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf31Q8CCF0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf31Q8CCF0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf31Q8CCF0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf31Q8CCF0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf31Q8CCF0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf31Q8CCF0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf31Q8CCF0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf31Q8CCF0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf31Q8CCF0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf31Q8CCF0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf31Q8CCF0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf31Q8CCF0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf31Q8CCF0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prpf31Q8CCF0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prpf31Q8CCF0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prpf31Q8CCF0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prpf31Q8CCF0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prpf31Q8CCF0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prpf31Q8CCF0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prpf31Q8CCF0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf31Q8CCF0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf31Q8CCF0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf31Q8CCF0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf31Q8CCF0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf31Q8CCF0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf31Q8CCF0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf31Q8CCF0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf31Q8CCF0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf31Q8CCF0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf31Q8CCF0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf31Q8CCF0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf31Q8CCF0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf31Q8CCF0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf31Q8CCF0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf31Q8CCF0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf31Q8CCF0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf31Q8CCF0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf31Q8CCF0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf31Q8CCF0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf31Q8CCF0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf31Q8CCF0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf31Q8CCF0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf31Q8CCF0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf31Q8CCF0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf31Q8CCF0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prpf31Q8CCF0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prpf31Q8CCF0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prpf31Q8CCF0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prpf31Q8CCF0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms