Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Bhlhe22Q8C6A8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Bhlhe22Q8C6A8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Bhlhe22Q8C6A8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms