Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc113Q8C5T8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc113Q8C5T8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc113Q8C5T8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc113Q8C5T8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc113Q8C5T8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc113Q8C5T8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc113Q8C5T8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc113Q8C5T8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc113Q8C5T8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc113Q8C5T8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc113Q8C5T8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc113Q8C5T8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc113Q8C5T8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc113Q8C5T8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc113Q8C5T8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc113Q8C5T8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc113Q8C5T8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc113Q8C5T8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc113Q8C5T8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc113Q8C5T8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc113Q8C5T8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc113Q8C5T8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc113Q8C5T8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc113Q8C5T8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc113Q8C5T8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc113Q8C5T8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc113Q8C5T8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc113Q8C5T8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc113Q8C5T8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc113Q8C5T8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc113Q8C5T8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc113Q8C5T8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc113Q8C5T8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc113Q8C5T8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc113Q8C5T8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc113Q8C5T8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc113Q8C5T8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc113Q8C5T8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc113Q8C5T8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc113Q8C5T8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc113Q8C5T8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc113Q8C5T8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc113Q8C5T8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc113Q8C5T8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc113Q8C5T8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc113Q8C5T8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc113Q8C5T8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc113Q8C5T8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc113Q8C5T8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc113Q8C5T8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc113Q8C5T8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc113Q8C5T8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc113Q8C5T8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc113Q8C5T8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc113Q8C5T8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc113Q8C5T8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms