Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R0

Usp37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp37Q8C0R0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp37Q8C0R0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp37Q8C0R0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp37Q8C0R0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp37Q8C0R0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp37Q8C0R0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp37Q8C0R0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp37Q8C0R0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp37Q8C0R0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp37Q8C0R0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp37Q8C0R0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp37Q8C0R0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp37Q8C0R0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp37Q8C0R0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp37Q8C0R0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp37Q8C0R0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp37Q8C0R0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp37Q8C0R0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp37Q8C0R0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp37Q8C0R0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp37Q8C0R0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp37Q8C0R0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp37Q8C0R0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp37Q8C0R0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp37Q8C0R0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp37Q8C0R0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp37Q8C0R0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp37Q8C0R0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp37Q8C0R0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp37Q8C0R0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp37Q8C0R0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp37Q8C0R0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp37Q8C0R0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp37Q8C0R0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp37Q8C0R0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp37Q8C0R0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp37Q8C0R0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp37Q8C0R0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp37Q8C0R0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp37Q8C0R0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp37Q8C0R0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp37Q8C0R0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp37Q8C0R0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp37Q8C0R0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp37Q8C0R0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp37Q8C0R0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp37Q8C0R0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp37Q8C0R0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp37Q8C0R0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp37Q8C0R0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp37Q8C0R0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp37Q8C0R0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp37Q8C0R0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp37Q8C0R0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp37Q8C0R0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms