Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg16l1Q8C0J2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atg16l1Q8C0J2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg16l1Q8C0J2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms